Со всем можно через fpm
cgi/ssh
chmod -R 777 blabladir
В логи апача глядеть на предмет того что или повысить макс клиентс или был сегфот чайлра
Поставьте stable
Версия панели какая
Поставить mpm peruser :)
fcgid php
десять пыхов
А еще можно не с диска а с памяти (memcache,md,tmpfs)
Если во время отвисания top крут, и дает 100% idle - то каналы
Дароже - это от слова даром? :)
