Главная страница получит много ссылочного веса. Его может быть достаточно, чтобы
увеличить PR (который видно на тулбаре) на единицу. А может быть и не достаточно.
Чтобы увеличить PR от 1 до 2 нужно меньше ссылочного веса, чем для увеличения от 2 до 3.
Даже если PR на тулбаре не изменится, вес главной страницы станет больше.
У Google для каждой страницы сайта есть свой PR (не только для главной страницы).
Ссылочный вес передаётся благодаря ссылкам с других страниц, даже если это страницы того же сайта.
Если на странице появится ссылка, ведущая на другой сайт, то она заберёт часть ссылочного веса у тех ссылок, которые ссылаются на страницы своего сайта. В результате у тех страниц немного понизится PR (не тулбарный).
Сквозная ссылка появится на каждой странице. Мне кажется, что из-за этого уменьшится вес всех страниц, что приведёт к ухудшению выдачи по многим запросам. Чем больше страниц на сайте, тем больший негативный эффект от сквозной ссылки.
А какая зона для www.google.com.ua будет лучше: www.site.biz, www.site.com или www.site.com.ua ? С какой зоны выдача получится выше?