а я замечал, причем не раз)
Перенасыщенность страницы ключевиком и некоторые другие нюансы в написании контента, которые не нравятся яндексу на текущий момент.
- личный
Сайт начинать продвигать нужно только когда полностью сверстан дизайн. Поскольку на последующие изменения в шаблоне яндекс может нервно отреагировать, понизив вам "рейтинг доверия" от чего вся последующая оптимизация может свестись к бесполезности.
Очень зависит в каком качестве будет сайт с точки зрения яндекса при первом попадании в индекс, если он будет переоптимизирован, либо (недайбог) в контенте окажется плагиат - то Ya загонит его в такую жопень, из которой можно и не выбраться(
1. при грамотном написании контента, большом количестве страниц и SEO-совместимом движке и большую часть НЧ запросов (если не все) можно выталкивать в ТОП внутренней перелинковкой. Простановку ссылок с досок, каталогов, закладок на внутряки лучше не делать (безусловно, ссылки на внутряки нужны, но только если они "трастовые" и необходимы они больше для разбавки...)
2. тут не совсем я понял насчет категорий товаров, поскольку среднечастотник среднечастотнику рознь, и подчас даст фору высокочастотнику по конкуренции.. Надо видеть структуру сайта, поскольку возможно что в вашем случае по данным запросам проще двигать главную.
Насчет анкоров - тут много подводных камней, ссылки с точным вхождением ставить надо, но желательно их "разбавлять" ссылками без ключевиков, либо с ключевиками и дополнительным текстом, например если ключевик "автомобили тойота", то разбавленный ключ "автомобили тойота со склада в Японии" -)
про хитрости проставления ссылок послушайте запись апрельского онлайн семинара seopult (есть на их сайте в разделе Seopult.Tv)