ТС какое количество доменов планируете регистрировать?
Советую Вам повнимательней разобраться с движком магазина и повнимательней прочитать раздел помощь в админпанели магазина, потому как большинство функций о которых Вы пишете уже реализованы в данном движке, (нужно только настроить), остальные модули можно найти на этом форуме http://forum.webasyst.ru/viewforum.php?id=22
а теперь можно взглянуть на каком этапе заявка?
сайт http://59i.ru
подавался в раздел
http://www.dmoz.org/World/Russian/Страны_и_регионы/Европа/Россия/Субъекты_Федерации/Пермский_край/
сейчас по умолчанию до 1000 ящиков можно завести на одном домене, но по моему эту цифру при необходимости можно увеличить после переговоров с яндексом.
самый простой способ, привязать ваш домен к почте Яндекса и в настройках разрешить пользователям самостоятельно заводить почтовые ящики на вашем домене.
если большое количество доменов, пишите в личку, продлим/зарегистрируем по 100руб.
Скиньте пожалуйста в личку примеры и тематики готовых сайтов
Скиньте демку или пример в личку
webasyst очень удобный скрипт, есть партнерка, 19 предустановленных шаблонов, можно получить готовый интернет магазин за один день.
У хостеров как правило цены на домены бывают выше реселлеров (если не учитывать проводимые хостером акции типа оплати за год хостинга и получи домен бесплатно), так что лучше делать все по отдельности.