возможно попали в бан или под фильтр ссылающиеся сайты
тематичность ссылки так же определяется и яндекс.директом, так что если ваш сайт в яке или в директе, то скорее всего ссылки с подобных сайтов другой тематики будут меньше весить чем с тех у кого не определена тематика. Вообще вес не зависит от пузомерок, нужно смотреть в превую очередь на другие характеристики...
а вам не кажется что регистрация в каталогах это уже прошлый век? =) с него выхлопа вобще нет. Вы наверно думаете сайты с тиц больше 1000 зарегистрировались в миллионе каталогов? =)
К тому же каталоги либо уже забанены либо будут забанены в течение ближайшего времени, яша уже давно выработал алгоритм забанивания таких "белых" каталогов или просто поискового спама.
тогда уж лучше в линкаторы идите толку больше будет и бесплатно =) это для тех кто за 3 бакса удавиться