Так точно! И даже просто думая мы влияем на этот мир. Мысли материальны. Древние говорили: "Прежде чем подумать - подумай".
Тут надо смотреть по всем запросам - насколько конкурентная тематика, также есть ли внутряки в топе и как много, а если есть, то что за сайт, какой возраст, бюджет и т.п. Если в топе одни морды, как например по запросу "пластиковые окна", то вероятность маленькая что вы туда со своими несколькими разделами/внутряками влезете. Нужно потратить время и провести анализ, что небесплатно.
Вообще если, есть возможность, лучше делать разные сайты с разным дизайном и наполнением, а там их уже можно между собой перелинковать, разместить баннеры и т.п.
Думаю, что ничего страшного - профиль-то немного другой, да и не будет 2-х сайтов одновременно в выдаче, т.к. запросы разные. Самое страшное в фильтре аффилиатов - стук конкурентов. У меня по одинаковому телефону и владельцу домена (владелеца, опять же, если боитесь, можно поставить в Private Person) еще не один сайт пока не попадал под фильтр. А про адреса вообще молчу - на одном адресе может быть десяток фирм. На крайняк, если боитесь - можно сделать отдельный телефон под розницу и дать его менеджеру, который розницей занимается.
Тогда первым делом добавляться платно в ЯК ;), если возьмут. И в примечании указывать про Россию сразу. В любом случае ЯК никогда лишним не бывает.
Ну и сделайте абсолютно другой сайт под розницу, можно на другом движке, домене, с другим дизайном. Цены будут разными, да и информация по идее по-другому должна подаваться для розницы, да и продвигаться он должен по совсем другим запросам - тогда не попадет под аффилиат.
Если url-ы и структура страниц останется той же, то никак, если ссылки закупались/проставлялись на какие-то старые страницы, то нужно будет поставить 301-е редиректы с url-ов старых страниц на новые.
http://metrika.yandex.ru/
Ищите iframe или левый javascript в коде или в шаблонах сайта.
Ну упасть не должен - для сайтов в ЯК не помню точно сколько можно указать регионов, до 7 что ли. Основной регион при этом останется. У меня получилось привязать к России.
Есть отличный сервис, где можно проверить по любому региону: seobudget.ru, проверка позиций стоит 0,03 руб за запрос, что очень недорого.