Вот тут есть что-то про дублирование страниц clean-param для яндекса
Регион, очевидно - вся Россия. отсюда и позиция, наверное.
Вообще нужно идти от малого к большому - начать с миллионников и потом уж добавлять другие города, так быстрее сайт разовьется. сайты с более конкретной тематикой, например: жилая недвижимость. проще продвинуть и развить. чем сайт "все обо всем". Никто не ищет недвижимоть в принципе. ищут либо место для бизнеса, либо жилье (хотя в отдельных случаях и то и другое).
ПС: ну это так - точка зрения брокера по ком. недвижимости. :)