Покажите top и ps axuf | grep php-cgi.
Софт я так понял под Windows?
Для подключеняи по ssh можно использовать свясзку winscp + putty. Там есть в настройках сохранять пароли.
1. Всё зависит от администратора.
2. http://ispsystem.com/software/ispmanager/requirements/
3. Windows Server 2008 R2 64 разрядная и там нет этой проблемы
4. Всё зависит от того что там будет ;)
Ubuntu 10.04 LTS документации пол интернета
тут проблема в том, что при дырявом скрипте и простом шеле на пхп можно добраться до всего и писать с правами www-data
По поводу конифга mysql - он у вас дефалтный?
Если у вас debian смотрите в директорию /usr/share/doc/mysql-server-5.0/examples/ там есть примеры тюнинга под разное кол-во памяти
Если не используете innodb отключите его.
Что установлено на сервере? Nginx, apache?
Дайте вывод команды top и конфиги
MX запись для корпоративной почты прописана правильно?
Внутрикорпаративная почта работает наружу?
Имхо смотрите в сторону DNS
А если там по дефалту DROP?