Наберите в качестве поискового запроса "site:http://[ваш сайт]/*"
выдача покажет только страницы в основном индексе (т.е. НЕ находящиеся под фильтром).
Если набрать просто "site:http://[ваш сайт]/" (без звёздочки в конце) - это будут все страницы (под фильтром и нет). Сравните выдачу. Если много страниц под фильтром, то в первую очередь убедитесь, что на них уникальный конент (с помощью программки Advego Plagiatus). Гугл учитывает только уникальный контент.
