Они понимают, что для сайта с такими данными: доноры - 733, внешние ссылки - 20787, делать это не обязательно. Сравнивать такой гигант как searchengines и "тематический блог" не правильно. Это тоже самое, что сравнивать Розетку с мелким региональным ИМ. На таких гиганты обычные правила не работают! Вот что будет с searchengines, а что с тематическим блогом если их прогнать по херовым каталогам?
Исходящие ссылки понижают вес сайта, так же само как и ссылающие ссылки дают Вашему сайту вес. Плохо это или хорошо решать Вам. Но как минимум их необходимо заключать в noindex и nofollow.
Поисковые системы считают вложенность не по УРЛ сайт.ввв/статьи/раздел/подраздел/статья, а по количеству кликов с главной до статьи.
Если правильно настроить редирект, то позиции не должны просесть.
Дизайн и структура может быть одинаковая, а вот контент должен быть разный. Текста, фото, описание, статьи должны быть уникальными. Оставить одинаковыми только характеристики и то, можно на каждом сайте добавить две-три характеристики уникальные.
На главной странице у Вас нет заголовка, а подзаголовки это Н3 с таким содержанием "H3 Информация", "H3 Служба поддержки", "H3 Дополнительно". Текст вообще не оптимизирован под запросы. Вообще не понятно, что Вы хотите продвигать.
На главной странице уберите циклическую ссылку (Картинка в шапке). Перейти на протокол HTTPS. У Вас проиндексировано 226 страниц, а в сайтмапе только 86. Отсутствую страницы товаров и страницы пагинации, попросите программиста настроить автоматическое добавление страниц в сайтмап.