Это я понимаю, а что насчет потери позиций по уже имеющимся ключам?
Да вот сам не могу определиться, синица или ... Вроди бы и понимаю что лучше поменять, а с другой стороны рисковать не хочется.
Есть ли вообще смысл в структуре по темам, поможет ли это в дальнейшем в продвижении или только для удобства?
Это не перелинковка, а пути переходов роботам для быстрой индексации, по крайней мере на это идет расчет.
Мета-тег скорее всего настроен с SEO плагина, в нем можно выставлять значения для мета роботс, поищите в нем.
Тайтл можно разнообразить, если это можно так назвать например добавляя к заголовку айдишник страницы, нужно в тайтл дописать скрипт по типу
<title><?php the_title(); ?> - <?php the_ID(); ?></title>
Что то в этом роде нужно проделать в шаблоне темы, тогда к тайтлу будет добавляться айдишник и заголовки не будут идентичны, но это решение не идеально, а лишь как пример