Правильней конечно сначала завершить техническую часть, а потом пихать в индекс, теперь очень сомневаюсь, что вам поможет шаблонная уникализация мета-данных.
Особо сайт не смотрел, но сразу бросились в глаза дублирующие страницы: О Компании, Доставка, Контакты и.т.п, правильней будет сделать их кликабельными на основной домен и закрыть в nofollow.
На контент конечно в целом может уйти очень много средств, насколько вижу, у каждого поддомена на главной странице есть место под текст - о магазине, попробуйте заказать уникальное описание (без размножения) под каждый регион, как можно больше, без воды, аналогично место под текст можно вывести в основные рубрики
Нет никакой разницы где размещены ваши сайты, если конечно вы по одному региону и идентичным запросам не продвигаете несколько сайтов — тогда наверняка попадете под аффилиат
Вообще если представляете компанию/фирму, лучше приобрести международный домен com/net/org и реализовать всё на поддоменах, по примеру: kz.companyname.com, ru.companyname.com, это конечно более сложный вариант, но у него есть свои плюшки
Drone2, Лучше использовать редирект, естественно закрытый в роботсе и прописать в шаблоне на страницу редиректа: <meta name="robots" content="noindex, nofollow" />.
Вообще и те и другие ссылки подходят для разбавления ссылочной массы, но редиректы в ЯВМ попадают крайне редко, надеюсь помог
