Первый вариант лучше. К тому же он более человечный.
Непосредственно на PR (Pagerank) использование протокола htpps не влияет никак.
Похоже на пингвин. А в вебмастере Гугл в разделе "Меры принятые вручную" тишина?
Воспользуйтесь сервисом https://seolib.ru/tools/pessimization-checker/, с помощью Яндекс Метрики, которая установлена на сайте. Вы сможете определить находиться ли сайт под фильтром ПС Google по датам выходов алгоритмов.
В случае с главной страницей ответ 200 вместо 301 не является проблемой, вот на примере searchengines.guru/ когда при проверки страницы со / отдает ответ 200 (см. скриншот) http://prntscr.com/8bcqzr
Сам давно ищу подобный сервис, пока ничего внятного не нашел.
Тоже пользуюсь этим сервисом.
В Яндексе вот так http://prntscr.com/8bbtmx
Если страница открывается только в одном из вариантов, значит проблема решена, если же открывается как со / так и без него, попробуйте вот этот редирект:
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule ^(.+)/$ /$1 [R=301,L]
Также проверьте как открываются внутренние страницы сайта, он также должны открываться в одном из вариантов либо со /, либо без него, для избежания дублей.
Я себе делал так:
- парсим коллектором какое то слово/тему (распарсиваем максимально)
- по быстрому фильтру там же в коллекторе отбираем все запросы со словами: "как", "где", "что", "зачем", "сколько" и т.д.
- группируем данные запросы по темам,
как то так
Не стоит пока сильно паниковать. Последние апы Яндекса показывают, что такие пляски позиций возможны. Вот если в более-менее долгосрочной перспективе ситуация сохранится, вот тогда стоит более детально вникать в сложившуюся ситуацию.