проблема в ssh, и частично вы уже сами нашли ответ.
нужно увеличить интервалы ожидания в файле /etc/ssh/sshd_conf
Спасибо, кто ж придумал то такую адскую команду?
PS
Нашёл регулярками:
find /var/www/ -type f -iname "*.php" | xargs grep -iR "\$_REQUEST\['.*']; eval(.*); exit"
Вроде всё вычистил, завтра ещё посмотрю. Спасибо за помощь.
