Есть подозрение, что самый лучший поисковик просто не справляется с таким объемом информации и выкидывает всё, что не влезает в его "базу". Ждите апгрейда железа, либо шлите своё прямо в логово Я, с пометкой "Яша, возьми это всё, но пусти в индекс". ;-)
Если верить Яндекс Вебмастеру - ТИЦ одного из проектов увеличился 29 сентября 2013: 0 -> 10
