Поставьте nginx и проксируйте на apache.
Для apache установите mod_rpaf и выключите KeepAlive
Конфиг my.cnf покажите
Есть стата munin по mysql?
Напишите ссылку на munin
В syslog или messages - нет ошибок связанных с дисками(ATA) ?
Дисков у вас сколько?
По смарту - 2 SATA
Есть третий?
Они выдают не более 3 серваков в одни руки.
/usr/local/ispmgr/var/
mysql же на ssd, какая от него нагрузка
iotop -oPa покажите еще
и оперативку (htop), мб все засвопалось просто
и очередь exim, sendmail проверьте, мб там море писем пытается отправить.
посмотреть логи установки
ошибку отправить в багтрекер.
http://bugtrack.ispsystem.com/
Установка обычно занимает до 20 минут
bugsmoran, по хедерам mail не спалят?
погугли
и посмотри, почему у тебя sendmail не может забиндить 25 порт
попробуй его kill -9 4568
и снова стартануть его
Что-то занимает порт
netstat -tuplan
да, квоты включить в контейнере
