Ссылочки

http:// и https:// это разные ссылки, вы все внешние ссылки ведете на другие страницы - 404-е, отсюда и обнуление ТИЦа. Вес, может и передают, только трастовость падает потому как ведут на 404-е страницы... Поэтому ничего хорошего ждать не нужно от внешних ссылок ведущих на 404ю страницу

Обнуление ТИЦ при переходе с http на https - явление нормальное, со слов тех. поддержки яндекса, всё восстановится через время.

Была аналогичная ситуация, через 2 апа ТИЦа после склейки, ТИЦ вернулся на прежнее значение. Но редиректы делали на всякий случай для внутренних страниц, на которые присутствовали внешние ссылки, и которые были в ТОПе в том числе без ссылок на них.

В тех поддержку яндекса не пробовали писать?

Переход на https был еще в том году, когда у сайта была старая структура, после склейки ТИЦ вернули.

Сейчас же полностью поменяли все URL.

А если я соберу все 404 страницы и переведу их на главную, то это будет в плюс или нет?

По идее если сделаете 301 на главную со всех страниц на которые ведут внешние ссылки - будет нормально.

Я сейчас зашел выгрузить ссылки и чудо, они опять на месте🤪

Стоит ли париться с редиректами?)

А куда они ведут? Если на 404 - то 301 редирект лишним не будет

Там были и ссылки на главную, но в основном да - 404.

Сейчас попробовал выгрузить внешние ссылки, написало что в течении недели сформирует архив. А быстрее никак нельзя?)

Вы через старый вебмастер смотрите?

Попробуйте через https://beta.webmaster.yandex.ru, у меня там все моментально выгрузилось и данные очень похожи на правду :)

новый вот что показывает)

Передают ☝