Перенос сайта.

Могу помочь дельным советом.

Раз поддержка спит, вам тоже можно ложиться спать.

Ну а по делу. Снести домен с одного места в разделе DNS ISPmanager, и содавить в другом.

Такое бывает когда хостинг-провайдер использует одини dns для vds и для shared хостинга.

Проблема тут не в созданном домене. ВПС - это ВПС. Там своя панель и свои конфиги. Они не знают, что там на шареде. Скорее всего Вы натолкнулись на стандартный баг, коему сто лет в обед.

Чинится так: заводите виртхост руками в ССШ (вот не помню толи в Апаче, толи в Нджинксе). Можно без особых конфигураций и врапперов. Потом в панели создаете свой домен. Он ругнется на Апач (ошибка сменится). Вот тогда не закрывая диалогового окна, стираете этот виртхост и жмете Ок на диалоговом окне. Вуаля.

Просто на шареде удалите доменное имя.

Скорее всего общие ДНС-сервера.

ну на шареде удалю - сайт выключится))

Пока вторичные физически удалят зону, её уже можно успеть добавить на vds, фактическая недоступность dns может составить пару секунд (открыли 2 вкладки браузере, одну на удаление, другую на добавление, с уже заполненной формой), если дело действительно в общем пространстве имен.

Удалите там и добавьте на ВДС как советовали, предварительно перенесите все.

99% общее пространство имен.

Либо просите хостинг как проснется, импортом без простоя перенесется, если нормально выполнить.

Удалите на шареде домен из раздела "Доменные имена", но в WWW домены оставьте все как есть. Домен на VDS создастся.