Старые страницы в индексе

Магазину около года, из-за фильтров на товары было огромное число дублей на каждую позицию, при 1.5к канонических страниц, наиндексировало гуглом больше 50к. В Яндексе вообще была только главная и пара страниц категорий в индексе. При этом урлы имели вид site.ru/index.php/... Владелец ИМ сказал, что хочет православные урлы без index.php и удалить безобразие с дублями. Фигня вопрос сделал реврайт, удалил дубли... При этом в роботс.тхт на день была запрещена индексация сайта.

Итог в Я страницы потихоньку индексируются и растут в выдаче, все довольны

А вот в гугле вот такая картина

Роботс.тхт нормальный ничего лишнего не запрещено, в Я такой же отлично индексируется. Сайтмап по новой структуре

При поиске гуглом по сайту выводятся 3-4 страницы с новым урлом все остальные с index.php.

Что сделать чтобы гугл начал индесировать новую структуру сайта?