А может весь секрет в кликабельности ссылки...?

Есть такое дело. Без метрики уже не определишь.

Но вероятно, Яндекс может получать информацию от других источников, к примеру LI. Вполне возможно, что они сотрудничают.

Если только как доп.сигнал. у меня на сайт частенько переходят с купленных ссылок, но на запросах это не отражается.

имхо, кликабельность может влиять только на ваше ранжирование (частично) и пф (напрямую). здесь и + по нч

на показатели тиц и пр если и могут влиять, то лишь очень-очень косвенно :)

хотя, кто его знает этот яндекс :) в целом, интересная теория