rel="canonical" не учитывается

Ещё до индексирования сайта прописал на основной массе страниц атрибут rel="canonical". Суть такая - есть база товаров с возможностью поиска по регионам. Планировалось что общая база (если регион не выбран) попадёт в индекс - остальное не попадёт. На страницы с выбранным регионом нет активных ссылок, но они могут попасть в индекс через метрику например (она отправляет просмотренные УРЛв в яндекс). Поэтому в каждой региональной странице был прописан <link rel="canonical" href="нерегиональная страница" />

В итоге в яндекс.вебмастере в "Результаты поиска" есть например страница без региона и страница с выбранным регионом "Москва".

Если смотреть поисковую выдачу - по одним запросам выдаёт региональную страницу, по другим - каноническую.

Как такое возможно?