виснет php

man limits.conf

Отредактируйте /etc/security/limits.conf - настройте через PAM лимиты для пользователя, от которого работает данный кронтаб (надеюсь, не root). Наиболее интересны Вам должны быть: rss, cpu, nproc, nice.

PS: И, конечно, "программисту" скрипта нужно что-то узнать о лок-файлах. Более чем вероятно, что запуск нескольких скриптов - "логикой" их работы вовсе не предусмотрен.

Если запускать скрипт из командной строки то php.ini не обязательно будет читаться (или не обязаельно будет читаться нужный)

можете сделать установить max_execution_time через ini_set

Если скрипт не просто висит в памяти, но и грузит CPU на 100%, то он явно что то делает еще. Просто при запуске в консоли за сколько выполняется ваш скрипт?

делайте отладку кода, например, методом половинного деления или подробным логированием происходящего.

скрипт через веб выполняется моментально. подобным способом запускаю, так как не хватает прав

Установите strace - посмотрите что делает скрипт.

А чем не вариант запустить "через web": wget -q http://site.ru/script.php ?

Вы ответили на свой вопрос, путь решения вам верно предложили:

От себя могу так же посоветовать lynx, если по каким то причинам нет wget.

прописал в скрипте

ini_set('max_execution_time',60);

помогло

а почему php не видит эту настройку из своего конфига?

Сомневаюсь... Раз, по Вашему описанию - скрипт "из веб" выполняется моментально.

Наверно, потому что это не его конфиг? Ы?

phpinfo() показывает где лежит конфиг и изменения в нём применяются