Не могу войти в категорию DLE

У Вас категория shops является подкатегорией(дочерней категорией) категории cars

Да, а cars в свою очередь является дочерним к catalog

А сами новости у вас относятся к какой категории, shops или cars?

Нужно открывать в последуещем порядке,как и распределены у вас разделы.

У главной категории есть подкатегория, а вы вводили так, что получалось наоборот). Думаю, вопрос исчерпан.

Если честно, не понял совсем

http://site.ru/catalog/cars/ тут у вас нет ни одной новости - вот и ошибка

Попробуйте добавить сюда http://site.ru/catalog/cars/ 1 новость.

beep, Настройка системы → Настройка вывода новостей

не обязательно правильно указывать структуру вложенности рубрик, мод реврайт берет все равно последнюю директорию