Куда может пропадать память с впс?

Как именно вы определяете, что процессы жрут 300-350 мегабайт?

На вашем "скриншоте" обозначено:

382580k used, 141708k free

Складываем... 382580+141708=524288... делим на 1024, получаем 512.

Что где пропало?

я захожу в исппанель и вижу сколько реально мегабайт используют процесы

Реальней, top ps, реальней нету, во блин матрица 🚬

Если есть тех подготовка, то велкам в мой блог: http://phpsuxx.blogspot.com/2010/05/ps-aux_11.html

Если вкратце, есть разделяемые библиотеки (подключены к многому софту, но память выделена для них лишь однажды), которые top / ps aux считают в сумме каждого процесса, отсюда и бОльшая величина суммы, чем есть памяти реально. Это абсолютно нормально :)

Вот скрипты, которые стали попыткой посчитать "реальное" использование памяти: http://phpsuxx.blogspot.com/2010/04/blog-post_9092.html

Если нехватает памяти - надо или софт перенастроить или памяти докупить

Вспомнил анекдот...

Начинающий программист считает, что в одном килобайте 1000 байт.

Законченный программист считает, что в одном километре 1024 метра :)