Многоязычный сайт - как лучше с точки зрения СЕО?

Вы верно рассуждаете.

Но решение этого вопроса лучше искать обратившись к вашей тематике, а также в зависимости от целей сайта.

На википедию и другие ресурсы-монополисты с заработком более миллиарда долларов обращать особого внимания не стоит, так как там выдача и прочие вопросы решаются не продвиженческими заслугами. А личными встречами.

Моё мнение:

Вариант 1: "Википедевский" (Ускоренная индексация, возможная расстановка географии для поддоменов сайта)

Такая схема больше подходит для информ-ресурса, который сможет продвигать себя самостоятельно как информ-среда с уникальным контентом (как, собственно вы и уже заметили в минусах)

Хочется добавить. Что разрабатывают алгоритмы поисковых систем далеко не глупые люди и уж, наверно, они учтут (если уже не учитывают), что ru.site.com и en.site.com при наличии односвязных блоков (ксс и прочего), а также ссылаемости друг на друга и "дублированном" контенте являются единым сайтом для различных стран.

Вариант 2: "Майкрософтовский" (Медленная индексация, проблематичная расстановка географии сайта для ПС, задается вручную + возможные проблемы в выдаче по разным странам)

На самом деле в некоторых случаях проблема индексации для другой страны задается весьма проблематично, но то было с год назад. Такая же версия подходит лучше для сайтов-услуг (исключением опять же являются огромные сайты, типа eBay,там из-за слишком большой аудитории создатели просто вынуждены всё раскидать по различным доменам и машинам в различных частях земного шара, прикрепив к своим филиалам. Дабы не кидать всё под одну гребенку и обеспечить лучшее быстродействие с пользователями.)

Опять же, теоретически, проблема для ПС вполне решаема, обратить наименование /EN/ как ключевое, но опять же есть ряд дополнительных сложностей.

+ На продвижение опять же придется потратить почти столько же ресурсов, сколько и в 1 случае. Ведь, разные поисковые машины(само собой есть исключения), разные языки, разная обработка веса, рейтингов и прочее прочее прочее...

Итог: первый случай наиболее удобен для всех типов. Второй лучше использовать на выдаче для одной страны/региона, предоставляя языковую альтернативу.

Спасибо за внимание.

st_falcon, под рунет и русские сайты версия английская как бы это отдельная опера... опция, что-ли.

Еще один + первого решения: за счет основного домена можно сеошить страновые версии сайта, в некоторых случая это более эффективною Ты накачиваешь морду основного сайта, а уже с него передаешь вес на страновые поддомены, причем это будет абсолютно органично выглядить.