индексация внутренних ссылок

Может у Вас nofollow стоит, не проверяли?..

nofollow не стоит

правда с попадания в индекс главной несколько дней прошло, может подождать нужно, хотя всё равно не понятно почему остальные страницы не проиндексированы

А как дела с яндексом обстоят, там все нормально?

не попали ещё

Что ж, печально :(

По сабжу:

Главная в индексе, остальные - нет? Я правильно понял?

Если так, то Вы сайт давно сделали?

Просто, может быть, надо немного подождать, да и со временем всё проиндексируется :)