google vs phpshop cms

Доброго времени суток! Столкнулся со следующей проблемой, перекинул старый HTML сайт на скрипт PhpShop Free CMS, хостинг инфобокс (с его настройкой "Перечень индексных файлов"), индексным был выбран index.php. Сайт проиндексировался, но в выдаче вылезали только внутрянки, проверяя список проиндексированных страниц нашёл site.ru/ и site.ru/index.php, так как контент идентичный предположил, что они склеины и выброшены из выдачи. Решил удалить настройку про индексные файлы, т.е. оставил поле пустым, сайт начал работать гораздо шустрее, но почему то гугла теперь окончательно отвернулся от моего сайта, трафик него 0, выпали все запроы. Может ли быть, что гугла начал его индексировать заново или может это какая то проблема движка? Если надо скину сайт в ПМ. Бан и песок - не вариант, сайт уже довольно старый и никак не нарушал правил гугла. В остальных ПС всё в норме.