Как правильно строить на сайте структуру URLов документов?

Оба варианта допустимы, я бы предпочёл 2-й вариант.

А лучше вот такой: www.site.ru/guide/brand/brend_my.html

Лишь бы все страницы были доступны для индексации ПС.

Аргументы такие

Первый вариант:

Преимущества:

Линейная структура каталога, т.е. основной раздел и подразделы. подразделы подтягивают основной раздел.

Возможные недостатки: страницы 3-го уровня вложенности (URL) имеют низкий приоритет

Второй вариант:

Преимущества:

Страницы имеют урлы 2-го уровня вложенности, и каждая из них получит больший приоритет в поиске.

Возможные недостатки:

Страницы будут конкурировать по основному запросу с основной.

И Возник вот какой вопрос теперь:

Как лучше сделать: на всех брендах сделать скажем /collections.html и тогде получится у меня 2000 страниц collections.html хоть и в разных каталогах

Или лучше сделать collections_brand.html (например /коллекции-адидас.html) чтобы лучше ранжироваться по запросу Коллекции адидас, и тогда все урлы страниц будут разные/

И вообще что скажете о русских урлах?

Если вы с главной поставите на все страницы ссылки, они все станут второго уровня. Уровень не зависит от вида УРЛ, а зависит от кол-ва кликов от главной☝

Вот так будет отлично: .../collections_adidas.html

Я бы не стал их использовать.