склейка зеркал в Google

Если в индексе Я уже домен, который Вы определили как главный из двух, то можете спокойно заливать htaccess с 301 редиректом и не заморачиваться. Google склеит точно, в Яндексе же, если они не склеятся, то my_site.ru просто пропадет из поисковой выдачи, а my_site.ru с www останется. Так что Вам нечего беспокоиться что сайт исчезнет из поисковой выдачи.

Извините за вторжение... Как правильно? (жирным выделил различия)

<IfModule mod_rewrite.c>

RewriteEngine On

RewriteBase /

RewriteCond %{HTTP_HOST} ^site\.ru

RewriteRule ^(.*)$ http://www.site.ru/$1 [R=permanent,L]

</IfModule>

<IfModule mod_rewrite.c>

RewriteEngine on

RewriteCond %{HTTP_HOST} ^site\.ru$ [NC]

RewriteRule ^(.*)$ http://www.site.ru/$1 [R=301,L]

</IfModule>

RewriteEngine On

RewriteBase /

RewriteCond %{HTTP_HOST} ^site.ru$ [NC]

RewriteRule (.*) http://www.site.ru/$1 [R=301] 

RewriteEngine on

RewriteCond %{HTTP_HOST} ^site.ru

RewriteRule (.*) http://www.site.ru/$1 [R=301,L]