Внутренние ссылки на главную влияют?

Если собираетесь анкоры делать вида "купить слона в том месте, где продаются розовые слоны, которые можно купить розового слона москва, когда розовый слон пукнул", то естественно будет пахнуть... Спамом в смысле :)

Все зависит от того, как все это преподнесете. Вот так делать - баня рано или поздно :)

Даже если у ссылок будут разные анкоры? А если скажем у меня будет одна ссылка href="mysite" а вторая href="/" захавает ли он вторую?

Анализируйте топы, например ремонт квартир

Есть , где внутреннюю перелинковку подсмотреть

Вообще-то, даже если первая ссылка с nofollow (как сейчас на сайте), Гугль вторую есть не станет.

Стало быть самое простое, это убрать nofollow с ссылки из логотипа.

Оптимальный вариант это добавить в alt атрибут img в логотипе ключевые слова. Хотя прятать текст за картинкой имеет место быть, мне кажется это не совсем правильно. (Да, на сайте сейчас нет картинки в HTML, значит можно добавить).

Можно, конечно, поместить логотип внизу кода (ниже контента или откуда будут ссылки на главную), но это на любителя.

ЗЫ: не имею понятия, как Яндекс такие ссылки обрабатывает. Вполне может быть, что у он учитывает несколько ссылок с одной страницы на другую.

многолинки в яше работают, только вопрос какой ссылочный вес передается по каждой конкретной ссылке неизвестно.