Создание Sitemap, для сайта у которого одна страница может иметь несколько урлов

Начнем с того, что это ненормально. А закончим перечислением уникальных урлов в sitemap.

так лучшее не делать, ибо поисковики не любять одинаковые страницы...

1. могут тупо выкинуть их из выдачи.

2. могут тупо пессимизировать...

3.могут по умному:)

Сделали мы это потому, чтоб сохранить информацию из той темы, из которой пришел пользователь.

Т.е. когда он приходит из темы1 на эту статью, то у него сверху пишется путь (чтоб он мог вернуться на предыдущие страницы) и рядом список других статей по теме1.

Если сделать один урл с динамическими параметрами, которые указывают путь пользователя, нормально ли будет реагировать поисковые роботы на динамический урл такого типа: some_url/ID?referer.

Если у статьи будет постоянный урл: articles/ID, но в php будет рассматриваться referer и выдаваться разный контент по нему, то как поисковики отнесутся к тому, что при одном и том же урле, мы получаем разный контент?

Думаю, сама логика ошибочна. У каждой страницы, как тут уже сказали д.б. один урл, если нужно пересылать посетителя с другой тематики делайте это при помощи ссылок.

Если мы все исправим, сильно и надолго ли мы упадем в выдаче?

Сейчас по ВЧ мы на 4-5 месте.

Стремно такое терять, хотя и понимаю, что надо в корне менять структуру сайта.

Rh+, как вариант, информацию о том, из какого раздела пришёл пользователь, можно хранить в куках.

Гугл обычно "клеит" такие страницы. Тогда при некоторых условиях можно увидеть пометку - "чтобы показать наиболее значимые результаты, мы опустили некоторые, очень похожие на * уже показанных.".