Иногда выскакивает банер над сайтом.

Может, у тебя на компе что-то?

Только выскакивает на моем сайте. Может это что-то о бегуна, там автоконтекст показы есть, может и показывает банер.

Едреныть, так и есть:

Что за баннер показывается у меня вверху страницы?

Это программа Бегун.Автоконтекст - показы.

Подключая Бегун.Автоконтекст, вы включаете:

- основную партнерскую программу Бегун.Автоконтекст - переходы, по которой оплата производится за переходы пользователей по текстово-графическим объявлениям с вашего сайта на сайт рекламодателя,

- дополнительную программу - Бегун.Автоконтекст - показы, с оплатой за показы на вашем сайте рекламных баннеров.

Бегун.Автоконтекст - показы не требует отдельного кода и работает на основе программы Автоконтекст-переходы (баннер может показаться там, где есть рекламный блок Бегуна). Разблокировать и заблокировать показ контекстных баннеров можно в настройках этой программы в персональном интерфейсе партнера.

Скорей всего кто-то прописал свой код от поп-ап партнерки.

Внимательней файлы на фтп проверьте.

Да не, ничего такого не вижу в коде.

Точно это Бегун.Автоконтекст - показы

Оффтопик...