Сайты не индексируется 3 мес

Только главная страница на одном site1.ru, а на втором site2.ru проидексировалась одна внутренняя (на неё были ссылки), а потом пропала. Сайты имеют необычную структуру, в начале каждого сайта идёт одинаковая страница, с которой ведут две ссылки на внутренности сайтов site1.ru/main site2.ru/main на доменах ру и ещё с двух доменов com site1.com site2.com такие же одинаковые страницы, ведущие на site1.ru и site2.ru, если зайти на любой из 4х доменов, там будет одинаковая входная страница. Я написал Яндексу, сказали, что этого из-за того, что возможно при запросе файла robots.txt нет ответа от сервера 404, это поправили 2 недели назад, вот после этого появилась одна внутренняя на site2.ru, а потом пропала.