как правильно регистрировать в каталогах?

Ptashechka, я задавал очень похожий вопрос в этой темке, почитайте.

Некоторые каталоги изначально добавляют приставку www к URL.

Так что лучше изначально брать адрес с www для избежание путаницы и не ломать мозг. ;))