Что за зону документа имел ввиду Яндекс, которая имеет преимущество

Ну, очевидно, зоны - что-то вроде тайтла и заголовков Hx.

Точно, как я сразу не догадался. А я думал Яндекс научился определять где текст расположен: до меню, в меню или в основном тексте или где-нибудь справа в невидном месте.

А что ж там определять - меню на всех страницах одинаковое, выделить его и перестать учитывать в расчётах не так уж сложно. Удивительно, что этого еще не делают.

так это-ж важная инфа для учета поисковиком ... иначе книга останется без своего рода оглавления

Я не говорю, чтобы вообще исключать ее из индекса. А просто не учитывать при определении релевантности - глупо получается, когда страница вылазит по запросу, который содержится только в меню.

Gray, логично ведь, что если на всех страницах, или хотя бы на большинстве имеется одна и та же фраза, то это скорее всего фирменный слоган, название фирмы или что-то подобное? И соответственно, по этой повторяющейся фразе сайт должен стоять несколько выше, нежели сайт, на котором эта фраза упомянута всего на одной странице. Потому начав вычленять повторяющиеся блоки, рискуешь потерять в релевантности выдачи.

Ничуть не рискуешь. Если это действительно какая-то решающая фраза или термин, то он будет употреблен и в других зонах, и в текстах ссылок. А учет повторяющихся (да еще и количества повторений) будет полезно только сайту с миллионом страниц для ранжирования по слову "Главная".

Ну, почему же не делают? ;) Кое-какие поражения в правах навигационные ссылки в Яндексе, судя по всему, получают.