Какими способами Google узнает, что по ссылке переходят?

Если на сайте стоит  Analytics - то отследить клик просто. Если не стоит - возможно он стоит на сайте, на который по ссылке переходят и тогда прочитать Referer тоже проблем не составит. Возможно и сам Хром эти данные сливает.

Это доказано? Количество ссылок с авторитетных и тематических ресурсов влияет. Это да. Но с чего вдруг количество переходов с других сайтов должно влиять на ранжирование в поиске?

Например потому что какой смысл от ссылки если по ней не переходят? Сразу понятно что это покупные ссылки и они не несут тот смысл который должны.

Ну так если ПС надо отличать покупные ссылки от естественных, это не значит, что такое производится через оценку их кликабельности. Бывают покупные, встроенные в контекст, и по ним кликают активно.

Это уже другой вопрос и на него нужно придумать другое решение. Это не первый человек от которого я слышу, что переходы по ссылкам влияют на ранжирование. Как первый этап решения тупости предпочтения сайтов по количеству купленных ссылок считаю правильным. Давно нужно убрать идиотизм с ссылками которые явно не являются показателем авторитетности сайтов, если их покупают.

Что за эксперименты? Где посмотреть почитать?

Про Узнает все через  хром конечно, и аналитикс но данные с шумом и не воспринимается как призыв к действию ( ранж) 

Естественные ссылки являются показателем качества и авторитетности сайта. Это очевидно. Они должны быть важным фактором ранжирования. 

Сомнителен лишь вопрос важности переходов по ним.

Вопрос в том, учитывает ли он эти данные при ранжировании. Аналитика стоит не у всех. СерчКонсоль инструмент по большей части показа инфы вебмастеру, а не для сбора данных.