Яндекс метрика фиксирует недоступность сайта

антибот есть?

Нет

если есть доступ к логам сервера, проверьте не блокилась ли страница вот таким подсетям:

87.250.224.xxx
213.180.192.xxx
5.255.253.xxx
5.255.192.xxx
5.45.192.xxx
37.9.64.xxx
95.108.128.xxx
77.88.0.xxx
93.158.128.xxx
141.8.128.xxx

Самый лучший выход это проверять еще каким-нибудь сервисом, пример https://ping-admin.ru/ (рефка)

Так хостинг не всегда напишет, что это на их стороне проблема. 

Точно, в последние дни недоступность фиксируется не один раз.

Здравствуйте! Пришлите, пожалуйста, мне в личные сообщения номер вашего счетчика. Посмотрим с командой Метрики, в чем может быть дело

Он может не работать если в  javascript много вложенности.

К примеру не будет работать:

<script type="javascript">

Всякие вызовы  сторонних скриптов.

Много символов

Стандартный счётчик

</script>

К примеру будет работать:

<script type="javascript">

Стандартный счётчик

</script>

Яндексе стоит ограничение на чтение длинны скриптов, чтобы уменьшить нагрузку на свои серваки.

Потёрто...