Это кто вам такую установку внушил? По вашему расчёт данных начинается с 10-ти? 

Для поддержки алгоритмов контроля безопасности сервисов Яндекса и обеспечения конфиденциальности социально-демографических данных в отчётах отключена детализация до уровня отдельных визитов и посетителей. Показываются только строки с информацией не менее чем по 10 посетителям.

Комментарий сотрудницы Яндекса Alexandra Kulachikova:

В агрегированных отчётах данные доступны за всё время работы счётчика и потенциально, используя разные комбинации группировок, можно получить персонализированные данные. Мы стараемся защищать конфиденциальность посетителей сайтов и показывать информацию об их поведении в анонимном виде. Данные Вебвизора недоступны за все время и не хранятся все время, поэтому там можно посмотреть поисковый запрос для визита, хотя сам посетитель остается анонимным.

Поэтому если вам потребуются данные по фразам встречающимся менее 10 раз, то проще всего собрать эти данные самостоятельно из Вебвизора.

Большое спасибо за ответ, но в вебвизоре не все данные отображаются.

А есть вообще что-то, какая-то система аналитики, чтобы можно было вбить 20 URL и мне  показало сколько было переходов из ПС и из каких именно?

Тогда Гугл.Аналитикс, но если с ним разбираться не хотите, попробуйте поставить LiveInternet и приспособиться к нему.

Можно поковырять инструментарий серверной аналитики типа AWStat.

Конечно, если Метрика не устраивает, а с Гугл.Аналитиксом связываться не хотите, то в любом случае придётся искать либо какие-то древние счётчики, либо какие-то малоизвестные кастомные компоненты к самому движку. 

Но уж лучше на мой взгляд Гугл.Аналитикс осилить.