Как вносить изменения в 100 сайтов-копий на wodpress?

Посмотрите в сторону D-Zerber или D-Zeus, разработчик на серче сидит. Оптимизирует работу с большим количеством сайтов, но для правильной работы надо бы поизучать программы.

Zennoposter

есть разные плагины для управления множеством сайтов из одной админки, например  MainWP он и синхронизировать инфу на сайтах может но насколько для вас он подойдет нужно проверять, тестировать, может дорабатывать)

Есть, называется процесс разработки  сайта. В аспекте стартпоста, заключается в том,  что одинаковые блоки не копируются в 100500 мест, а берутся из одного места. И при необходимости изменений они соответственно вносятся в одно место, а не в 100500.

Возможно, вы выбрали не ту CMS или не тот способ реализации своей задумки.

Сайты на одном хостинге?

Синхронизировать нужно базу или файлы?

И давно ты стал в ВП разбираться? :)  задавая такие дурацкие вопросы.

Разные сайты в сети или абсолютно разные?

Впрочем, в любом случае webinfo прав - всё сделано не правильно и надо бы переделывать.