Как найти неполные дубли на сайте?

А где там это делается? 

Configuration - Spider, вкладка Extraction, отметить галочкой Store HTML (внизу).
Потом Configuration - Content - Duplicates. Там отметить галочкой Enable Near Duplicates и задать степень похожести (по умолчанию стоит 90%). Я обычно выставляю 80%, но тут дело хозяйское.
Парсим.
После этого - Crawl Analysis. Ну, а дальше смотреть, что на что похоже и в какой степени. А, ну и я бы посоветовал в качестве User-Agent выбрать что-то осмысленное, типа Googlebot Smartphone. Иногда полезно разными UA посмотреть - бывают нюансы, особенно если речь об адаптивной вёрстке.

Кроме того, можно использовать сторонние сервисы - типа siteliner.com, но там бесплатно - только 200 страниц, остальное - за бабки. 

Благодарю. Была 11я версия, не знал о таком нововведении.

Но "кладёт" он сайт, почему то очень быстро. Раньше такого не было. Мини ДДОС атака :)

О. Это повод пообщаться с хостером для начала. Если фрога достаточно чтобы его положить - то он и от поисковых ботов приляжет и отдаст пачку пятисотых в самый неподходящий момент.
Ну, и можно же парсер настроить, чтобы помягче данные тянул.
Сейчас 15-я версия актуальна, они туда воткнули, например, сравнение версий сайта - что было, что стало.

М-да. Даже не знаю как интерпретировать.

У себя нашел 1700 таких неявных дублей (около 8% от всех страниц).

Ну, думаю, может это и есть причина падения. Много ж дублей. Еще год назад Яшка такие карточки и разделы в НКС забрасывал, а теперь шифрует - известный факт, элемент алгоритма ж теперь не фильтр (СУКА). Уже даже составил план уникализации.

Только что решил сопоставить с ситуацией у нереально растущего конкурента. У них 3300 страниц неуникальных дублей из "Нашлось 4 тыс. результатов". Т.е. почти все!

Как так то? Люди 100% не крутят ПФ.