Отключается настройка вебвизор в метрике

Добрый день! Скажите вы уже обращались по этому вопросу в поддержку?

Нет, я просто беру и включаю заново.

Там надо код счетчика менять, если этого не сделать, то настройка слетает видимо. Может быть в этом причина?

Нюанс в том, что на сайте код счетчика был с вебвизором

Если ситуация повторяется часто, то это лучше проверить на стороне сервиса. Рекомендую в дальнейшем, написать команде поддержки вместе с номером счётчика. Проанализируют ситуацию и постараются решить вопрос: https://yandex.ru/support/metrica/troubleshooting/webvisor.html#webvisor