Замена темы

Содержимое текстовых виджетов хранится в базе данных. А header.php и т.д. - это же файлы темы. Меняется тема, код из файлов удаленной темы никак не может остаться на сайте. То есть, зависит от того, как был добавлен счетчик. Я, к примеру, иногда вставляю в виджет, иногда в header.php

Все сменится, что размещено в файлах темы. А все изменения в файлах вордпресс сохранятся.

В "файлах вордпресс" нормальные люди изменения не делают. А сохранится то, что в базе и что сделано мимо ВП (начиная от физ. роботсов, если они есть и тд).