mysql 5.6.45 mysqltuner innodb_buffer_pool_instances

Совсем нет, сутки - общая рекомендация, чтобы быть уверенным что всё, что надо закешировано. Вообще на практике здорово зависит от характера нагрузки - иногда изменения видно в первые секунды после запуска, иногда несколько часов.... А иногда и суток мало.

Ну ЕСССЕЕЕЕЕЕЕЕЕЕСНООООООООООООО это общая рекомендация. Что как детям то объяснять? 🤪

Размер одних только индексов около 5 гигов.

Ну и заполнение 4гб из 4х за несколько часов работы.

Характер нагрузки:

4 таблицы по 2-5 миллиона записей.

В основном селекты с джоинами и немного лайков %*%.

По ощущениям на 4х гигах отклик был мгновенный, а сейчас проскакивает 0.1-05 сек. За сутки накопилось 70 страниц грузившихся более 2 секунд, до этого было 5-10.

есть еще момент.

таблица на полтора миллиона записей каждое утро обновляется полностью.

остальные таблицы тоже много изменений терпят в ночное время.

Настройте нормальный мониторинг сервера и mysql сервера в частности.

Самый простой вариант, это munin. Есть очень простые и наглядные плагины для него.

Проблема может быть совершенно не в mysql, а соседнем сервисе, бэкапе, ротации логов, синхронизации рейда или чем-то подобном.

Дальше смотрите на картинки и соотносите факты.

Также удобно смотреть как изменение настроек меняет поведение сервера.