Нужно ли делать для профилактики проверку файловой системы на сервере утилитой fsck?

Нужно прочитать документацию к файловой системе. На работающем сервере никаких проверок быть не может. В общем случае нужно смотреть за логами системы, специально проверки проводить не нужно.

Dmitriy_2014, не рекомендую, так как для нормально работы нужно размонтировать диск. В противном случае есть шанс, что вы испортите файловую систему. Утилита может принять изменения на диске за ошибку анализа в своем проходе и начать восстановление, тем самым нарушить файловую систему.

Если все равно решите проверять, то только с параметром -n это не внесет исправления. Либо shutdown -rF now проверка после перезагрузки. Либо используйте другие методы.

SocFishing, Справедливости ради следует сказать, что некоторые файловые системы умеют в онлайн-проверки и в онлайн-восстановление. В настоящее время работы над добавлением соответствующего функционала ведутся в XFS. Ну и разные ФС требуют разного обращения в разных условиях. Пусть читает документацию и разбирается в первую очередь: напрмер, btrfs или ZFS я бы без scrub время от времени не запускал. Проверка должна проводиться каждый раз после внештатного выключения системы - для этого нужно, соответственно, логи просматривать потом. Нюансы есть: в обще случае не только ФС нужно проверять, но и базу пакетного менеджера, состояние баз данных.

Учитывая уровень вопроса - очень опасно! Чем меньше вы будете лезть в сервер - тем будет лучше для него (и для вас)