дани мапов

$("input[name='answer']").click(function () {
        if ($(this).val() != 0){
..............

Вместо первой строки

$string = file_get_contents('main.html');

Вместо последней строки

file_put_contents('newmain.html', $newstring);

PHP > 5.3

$string = "Test: mashina, mashina, mashina end";

$index = 0;
$newstring = preg_replace_callback(
    '@mashina@',
    function($match) use (&$index) {
		$index++;
		return ($match[0] . $index); 
		
	},
    $string
    );
echo $newstring;

Нагрузка не уменьшится.

Нормальное решение, можно и не регулярками, а через str_replace производить замену названия папки.

Можно еще через JS скрыть, как тут - http://web-ru.net/sajtostroenie/texnicheskie-momenty/kak-skryt-ssylku-cherez-javascript-metody-skrytiya-ssylok-na-stranice.html

echo json_encode($array);

В админке попробуйте включить обработку сессий - База данных.

Так вторая база будет на том же сервере?

Конечно может появиться, хотя бы обновите движок до актуальной версии.