мм, я конечно сам в этом деле многое непонимаю, но отвечу.
1) Если вы про SSH, то необезательно лазить из под консоли, можно и другие клиенты.
Ну а если необходимо из под консоли, можно установить Midnight Commander , для убунты :
apt-get install mc
и потом в консоле набираем mc и все.
2)Чуть выше описали.
3)Ммм, под акселераторами я понимаю чуть другие вещи, такие как eAccelerator (http://www.eaccelerator.net) , Alternative PHP Cache (APC) (http://pecl.php.net/package/APC) , XCache (http://trac.lighttpd.net/xcache/) , вот три , на мой взгляд, самых известных php акселератора.
Ещё можно установить Zend Optimizer , он воопще нужен для работы скриптов защифрованных под зендом, но мне показалось, что после его установки, у меня сайты получше начали рабоать :).
Насчет nginx , ну воопще хорошо бы поставить связку apache + nginx , и настроить таким образом , чтобы nginx обрабатывал css, js, jpg, gif, exe, tar, pdf итп, легким веб-сервером nginx мы снизим нагрузку на веб-сервер Apache и получим хороший прирост к производительности.
