[umka]

В DNS должны быть A-записи для домена и тех поддоменов, по которым должны открываться сайты.

Например:

domen.ru. IN A 123.45.67.89

www IN A 234.56.78.90

Это записи для основного домена и поддомена "www".

Поддомены, для которых нет A-записей (или CNAME), открываться не будут.

Скриншоты ни о чём.

Для http несколько десятков процессов — это нормально.

Загрузка системы (Load average) должна быть не более 1 х кол-во физических ядер.

Для начала смотрите вывод команды top в момент возникновения проблемы.

Каким способом отправляете письмо?

В phpinfo() что в переменной sendmail_path?

И при чём здесь постфикс? :)

Какие именно агенты у вас перестали работать? Какие сообщения об ошибках? Прочие симптомы?

Популярнее всего та виртуализация, с которой лучше всего знаком ваш администратор.

Если у вас не запрещена функция proc_open, то proc_close точно не представляет опасности.

Но вопрос в том, если proc_close запрещена, то почему не запрещена proc_open?

А если proc_open тоже запрещена, то на кой разрешать proc_close?

:)

wayly, а такого, что всё прям само, "сэль и паехаль" — ни где не бывает.

Не понятно тогда, где у вас эти лимиты устанавливаются. Сделайте по совету WapGraf, прямо в init-скрипте.

В логе та же ошибка?

PHP-скрипт на этом же хосте что выдаёт?

<?php
echo `ulimit -n`;
?>

Хотя ... ошибка же в логе nginx.

Поищите, не задаётся ли это ограничение специально для nginx в файлах /etc/security/limits.conf или /etc/security/limits.d/* ?

Чтобы поменялось, нужно разлогиниться и зайти заново.

А чтобы поменялось для nginx, его нужно перезапустить.