Думаю, что лучше не трогать. Страницы удалять не надо. Можно попробовать поставить робота (robots.txt). Тут все по честному - страницы остались - а робот - это пожелание администратора домена по правилам индексации.....
Думаю, что робот испортить ни чего не должен, даже соответственно наоборот, учитывая что индексируемая часть сайта будет больше соотвествовать тематике.
Правда если робот закроет 90% всего контента, то посещаемость может упасть. Ведь страниц на которые имеет смысл отправлять пользователя останется только 10%........
Преждевременно соваться не надо в серьезные каталоги, а во всякие мусорные вполне можно. Хуже не будет....