где то в файлах прописан старый абсолютный путь
чтобы получать данные с других серверов на них должен быть munin и настроить Munin master > slave node
обычно на debian проблем нет, все работает по дефолту, а mysql_ по моему устаревший плагин
попробуй установить
обычно достаточно mysql_queries mysql_slowqueries mysql_threads
часом не стоит Disqus comments ?
openvz чтоли ? это не возможно
нужно добавить в конфиг в случае с nginx и apache
мало ему воркеров
может у вас апач в mysql упирается ? munin помогает оценить ситуацию и mysqltuner.pl
почти так же оказалось, с небольшими отличиями:
в rescue
в итоге получил
оказалось
подождал окончания ресинка и команды выполнились уже без ошибок
попробуй добавить
exim restart