Конечно лучше, если цена совпадает :)
P.S. VDS обычно строят на SAS 15к
Остается добавить внешний FTP для резервного хранения данных и учесть те траблы, что обязательно случаются с оборудованием, а свой неттоп (диск ли, блок питания) ремонтировать иногда придется.
VDS / VPS не сильно уступают (у 1С-Битрикс есть общие тесты производительности среды) проверяли.
